Organisasi ini berdiri sejak berdirinya Fakultas Kedokteran Universitas Wijaya Kusuma Surabaya pada tahun 1986 . Sejak 1986 sampai 2003 bernama Senat Mahasiswa. Tahun 2003 hingga sekarang sudah berganti nama Badan Eksekutif Mahasiswa Fakultas Kedokteran Universitas Wijaya Kusuma Surabaya yang disingkat sebagai BEM FK UWKS. Reaktualisasi peran BEM FK UWKS sebagai wadah untuk membentuk mahasiswa yang berjiwa revolusioner, memiliki gebrakan, netral, berfikir secara rasional dan simultan. Adapun pada kepengurusan BEM FK UWKS periode 2021 / 2022 memiliki nama kabinet, yakni kabinet " Selaras Mengabdi ". Sebuah kabinet yang memiliki tujuan untuk bersama dan selaras menjadi inspirasi bagi penggerak dan penerusnya.